MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 plasmid pO157

Total Repeats: 1832

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013010	ATGA	2	8	1	8	50 %	25 %	25 %	0 %	254667449
2	NC_013010	GA	3	6	7	12	50 %	0 %	50 %	0 %	254667449
3	NC_013010	GCT	2	6	91	96	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667449
4	NC_013010	ATA	2	6	98	103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254667449
5	NC_013010	ATTT	2	8	112	119	25 %	75 %	0 %	0 %	254667449
6	NC_013010	AAG	2	6	209	214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254667449
7	NC_013010	CTG	2	6	253	258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667449
8	NC_013010	GTCC	2	8	262	269	0 %	25 %	25 %	50 %	254667449
9	NC_013010	TGA	2	6	279	284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667449
10	NC_013010	GAT	2	6	313	318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667449
11	NC_013010	AAT	2	6	319	324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254667449
12	NC_013010	TCC	2	6	351	356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254667449
13	NC_013010	TCA	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254667449
14	NC_013010	GGT	2	6	403	408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667449
15	NC_013010	AAAC	2	8	465	472	75 %	0 %	0 %	25 %	254667449
16	NC_013010	AAT	2	6	514	519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254667449
17	NC_013010	TGG	2	6	524	529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667449
18	NC_013010	T	6	6	641	646	0 %	100 %	0 %	0 %	254667449
19	NC_013010	TCT	2	6	684	689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254667449
20	NC_013010	AAT	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254667449
21	NC_013010	CTGC	2	8	778	785	0 %	25 %	25 %	50 %	254667449
22	NC_013010	TGT	2	6	878	883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254667449
23	NC_013010	CAAAGA	2	12	939	950	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	254667449
24	NC_013010	TAA	2	6	999	1004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254667449
25	NC_013010	TGG	2	6	1077	1082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667449
26	NC_013010	ATA	2	6	1223	1228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254667449
27	NC_013010	TGG	2	6	1263	1268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667449
28	NC_013010	AAC	2	6	1402	1407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254667449
29	NC_013010	GATGG	2	10	1418	1427	20 %	20 %	60 %	0 %	254667449
30	NC_013010	A	6	6	1432	1437	100 %	0 %	0 %	0 %	254667449
31	NC_013010	CAAA	2	8	1465	1472	75 %	0 %	0 %	25 %	254667449
32	NC_013010	AAT	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254667449
33	NC_013010	CTG	2	6	1562	1567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667449
34	NC_013010	ATC	2	6	1606	1611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254667449
35	NC_013010	T	7	7	1617	1623	0 %	100 %	0 %	0 %	254667449
36	NC_013010	TCC	2	6	1651	1656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254667449
37	NC_013010	AC	3	6	1707	1712	50 %	0 %	0 %	50 %	254667449
38	NC_013010	GCTGA	2	10	1771	1780	20 %	20 %	40 %	20 %	254667449
39	NC_013010	GTC	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667449
40	NC_013010	ATA	2	6	1862	1867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254667449
41	NC_013010	GAC	2	6	2052	2057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667449
42	NC_013010	TGG	2	6	2060	2065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667449
43	NC_013010	GAT	2	6	2143	2148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667449
44	NC_013010	AAG	2	6	2195	2200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254667449
45	NC_013010	AAC	2	6	2236	2241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254667449
46	NC_013010	CA	3	6	2289	2294	50 %	0 %	0 %	50 %	254667449
47	NC_013010	GGCA	2	8	2378	2385	25 %	0 %	50 %	25 %	254667449
48	NC_013010	TTG	2	6	2489	2494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254667449
49	NC_013010	TGC	2	6	2534	2539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667449
50	NC_013010	A	6	6	2611	2616	100 %	0 %	0 %	0 %	254667449
51	NC_013010	TA	3	6	2675	2680	50 %	50 %	0 %	0 %	254667449
52	NC_013010	AAT	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254667449
53	NC_013010	TAT	2	6	2768	2773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254667450
54	NC_013010	GTT	2	6	2774	2779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254667450
55	NC_013010	TTAT	2	8	2808	2815	25 %	75 %	0 %	0 %	254667450
56	NC_013010	CAT	2	6	2904	2909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254667450
57	NC_013010	GCA	2	6	2925	2930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667450
58	NC_013010	GC	3	6	2956	2961	0 %	0 %	50 %	50 %	254667450
59	NC_013010	GAA	2	6	2991	2996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254667450
60	NC_013010	GTTTT	2	10	2998	3007	0 %	80 %	20 %	0 %	254667450
61	NC_013010	ATC	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254667450
62	NC_013010	GAT	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667450
63	NC_013010	GGA	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254667450
64	NC_013010	ATA	2	6	3163	3168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254667450
65	NC_013010	ACAG	2	8	3169	3176	50 %	0 %	25 %	25 %	254667450
66	NC_013010	TTA	2	6	3250	3255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254667450
67	NC_013010	ATA	2	6	3295	3300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254667450
68	NC_013010	A	7	7	3304	3310	100 %	0 %	0 %	0 %	254667450
69	NC_013010	AAT	3	9	3324	3332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254667450
70	NC_013010	TAA	2	6	3416	3421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254667450
71	NC_013010	GCA	2	6	3545	3550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667450
72	NC_013010	AAATAA	2	12	3580	3591	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	254667450
73	NC_013010	ATG	2	6	3616	3621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667450
74	NC_013010	G	6	6	3724	3729	0 %	0 %	100 %	0 %	254667451
75	NC_013010	TAA	2	6	3808	3813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254667451
76	NC_013010	TTCT	2	8	3885	3892	0 %	75 %	0 %	25 %	254667451
77	NC_013010	AGT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667451
78	NC_013010	CGG	2	6	3979	3984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254667451
79	NC_013010	TGA	2	6	4019	4024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667451
80	NC_013010	GTT	2	6	4026	4031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254667451
81	NC_013010	GGT	2	6	4037	4042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667451
82	NC_013010	GTAA	2	8	4047	4054	50 %	25 %	25 %	0 %	254667451
83	NC_013010	TGC	2	6	4081	4086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667451
84	NC_013010	GTG	2	6	4119	4124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667451
85	NC_013010	TGA	2	6	4150	4155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667451
86	NC_013010	TGC	2	6	4163	4168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667451
87	NC_013010	TGA	2	6	4171	4176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667451
88	NC_013010	TTG	2	6	4192	4197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254667451
89	NC_013010	ATC	2	6	4401	4406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254667451
90	NC_013010	AGG	2	6	4432	4437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254667451
91	NC_013010	GCGAAG	2	12	4476	4487	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	254667451
92	NC_013010	CAG	3	9	4514	4522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667451
93	NC_013010	TCG	2	6	4673	4678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667451
94	NC_013010	TGG	2	6	4690	4695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667451
95	NC_013010	CAT	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254667451
96	NC_013010	AGG	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254667451
97	NC_013010	AGG	2	6	5152	5157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254667451
98	NC_013010	CCA	2	6	5185	5190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254667451
99	NC_013010	GGT	3	9	5261	5269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667451
100	NC_013010	GGA	2	6	5271	5276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254667451
101	NC_013010	CTG	2	6	5319	5324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667451
102	NC_013010	ACAG	2	8	5369	5376	50 %	0 %	25 %	25 %	254667451
103	NC_013010	TAT	2	6	5411	5416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254667451
104	NC_013010	AAC	2	6	5501	5506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254667451
105	NC_013010	GCG	2	6	5580	5585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254667451
106	NC_013010	TGC	2	6	5588	5593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667451
107	NC_013010	AGT	2	6	5623	5628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667452
108	NC_013010	TTTTCC	2	12	5663	5674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254667452
109	NC_013010	TGC	2	6	5694	5699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667452
110	NC_013010	AGG	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254667452
111	NC_013010	GGA	2	6	5731	5736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254667452
112	NC_013010	CGG	2	6	5805	5810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254667452
113	NC_013010	AGC	2	6	5834	5839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667452
114	NC_013010	TGA	2	6	5854	5859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667452
115	NC_013010	ATG	2	6	5870	5875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667452
116	NC_013010	TCC	2	6	6090	6095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254667452
117	NC_013010	GGT	2	6	6206	6211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667452
118	NC_013010	TGC	2	6	6267	6272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667452
119	NC_013010	TGC	2	6	6307	6312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667452
120	NC_013010	GCA	2	6	6325	6330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667452
121	NC_013010	CCG	2	6	6358	6363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254667452
122	NC_013010	ATT	2	6	6374	6379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254667452
123	NC_013010	ACG	2	6	6413	6418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667452
124	NC_013010	CTG	2	6	6437	6442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667452
125	NC_013010	TCAG	2	8	6504	6511	25 %	25 %	25 %	25 %	254667452
126	NC_013010	GC	3	6	6556	6561	0 %	0 %	50 %	50 %	254667452
127	NC_013010	GTG	2	6	6584	6589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667452
128	NC_013010	GCA	2	6	6686	6691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667452
129	NC_013010	GC	3	6	6693	6698	0 %	0 %	50 %	50 %	254667452
130	NC_013010	CCT	2	6	6725	6730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254667452
131	NC_013010	GTC	2	6	6798	6803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667452
132	NC_013010	GTCAG	2	10	6810	6819	20 %	20 %	40 %	20 %	254667452
133	NC_013010	ATGGAC	2	12	6833	6844	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254667452
134	NC_013010	AGGGGG	2	12	6972	6983	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	254667452
135	NC_013010	GAG	2	6	7073	7078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254667452
136	NC_013010	GTT	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254667453
137	NC_013010	TGC	2	6	7213	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667453
138	NC_013010	CACT	2	8	7272	7279	25 %	25 %	0 %	50 %	254667453
139	NC_013010	CG	3	6	7303	7308	0 %	0 %	50 %	50 %	254667453
140	NC_013010	G	6	6	7308	7313	0 %	0 %	100 %	0 %	254667453
141	NC_013010	AGC	2	6	7314	7319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667453
142	NC_013010	GTT	2	6	7397	7402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254667453
143	NC_013010	TGG	2	6	7531	7536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667453
144	NC_013010	CGG	2	6	7537	7542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254667453
145	NC_013010	GTG	2	6	7566	7571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667453
146	NC_013010	GTC	2	6	7576	7581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667453
147	NC_013010	AGC	2	6	7597	7602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667453
148	NC_013010	TGG	2	6	7660	7665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667453
149	NC_013010	CCCTT	2	10	7741	7750	0 %	40 %	0 %	60 %	254667453
150	NC_013010	GCT	2	6	7773	7778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667453
151	NC_013010	TCA	2	6	7880	7885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254667453
152	NC_013010	CTG	2	6	7887	7892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667453
153	NC_013010	CG	3	6	7921	7926	0 %	0 %	50 %	50 %	254667453
154	NC_013010	GCT	2	6	7985	7990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667453
155	NC_013010	GTG	2	6	8008	8013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667453
156	NC_013010	TCA	2	6	8039	8044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254667453
157	NC_013010	ATG	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667453
158	NC_013010	GCC	2	6	8187	8192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254667453
159	NC_013010	CA	3	6	8216	8221	50 %	0 %	0 %	50 %	254667453
160	NC_013010	TGG	3	9	8257	8265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667453
161	NC_013010	CAA	2	6	8324	8329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254667453
162	NC_013010	ATG	2	6	8331	8336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667453
163	NC_013010	TGG	2	6	8419	8424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667454
164	NC_013010	TGG	2	6	8455	8460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254667454
165	NC_013010	ATAAGG	2	12	8479	8490	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	254667454
166	NC_013010	TGA	2	6	8506	8511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667454
167	NC_013010	ATA	2	6	8557	8562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254667454
168	NC_013010	CCG	2	6	8657	8662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254667454
169	NC_013010	G	9	9	8680	8688	0 %	0 %	100 %	0 %	254667454
170	NC_013010	GAT	2	6	8769	8774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667454
171	NC_013010	GAT	2	6	8836	8841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667455
172	NC_013010	TTG	2	6	8852	8857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254667455
173	NC_013010	ATC	2	6	8910	8915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254667455
174	NC_013010	CAA	2	6	8918	8923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254667455
175	NC_013010	CAG	2	6	8972	8977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667455
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177	NC_013010	GAGG	2	8	9071	9078	25 %	0 %	75 %	0 %	254667455
178	NC_013010	G	6	6	9133	9138	0 %	0 %	100 %	0 %	254667455
179	NC_013010	GAT	2	6	9149	9154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667455
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182	NC_013010	GAGGT	2	10	9243	9252	20 %	20 %	60 %	0 %	254667455
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185	NC_013010	GAG	2	6	9287	9292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254667455
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192	NC_013010	TAGAGG	2	12	9647	9658	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	254667456
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195	NC_013010	CTG	2	6	9948	9953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667457
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198	NC_013010	CCG	2	6	10024	10029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254667457
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212	NC_013010	TGA	2	6	10774	10779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667458
213	NC_013010	TCTG	2	8	10951	10958	0 %	50 %	25 %	25 %	254667458
214	NC_013010	CTG	2	6	10973	10978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667458
215	NC_013010	GCT	2	6	10993	10998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667458
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222	NC_013010	GAGG	2	8	11278	11285	25 %	0 %	75 %	0 %	254667458
223	NC_013010	A	8	8	11293	11300	100 %	0 %	0 %	0 %	254667458
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230	NC_013010	GAGGT	2	10	11698	11707	20 %	20 %	60 %	0 %	254667459
231	NC_013010	TGC	2	6	11708	11713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667459
232	NC_013010	TGC	2	6	11726	11731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667459
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239	NC_013010	GCA	2	6	12120	12125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667459
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242	NC_013010	CTG	2	6	12286	12291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667459
243	NC_013010	CAG	3	9	12333	12341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667459
244	NC_013010	GGC	2	6	12366	12371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254667459
245	NC_013010	CAG	2	6	12397	12402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667459
246	NC_013010	CAG	2	6	12445	12450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254667459
247	NC_013010	GTC	2	6	12467	12472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667459
248	NC_013010	A	6	6	12503	12508	100 %	0 %	0 %	0 %	254667459
249	NC_013010	GCT	2	6	12541	12546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667460
250	NC_013010	GTT	3	9	12569	12577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254667460
251	NC_013010	A	7	7	12648	12654	100 %	0 %	0 %	0 %	254667460
252	NC_013010	AGTGG	2	10	12658	12667	20 %	20 %	60 %	0 %	254667460
253	NC_013010	ACA	2	6	12673	12678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254667460
254	NC_013010	ACCC	2	8	12924	12931	25 %	0 %	0 %	75 %	254667460
255	NC_013010	CGCTT	2	10	12985	12994	0 %	40 %	20 %	40 %	254667460
256	NC_013010	TG	3	6	13058	13063	0 %	50 %	50 %	0 %	254667461
257	NC_013010	AGT	2	6	13064	13069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667461
258	NC_013010	TTG	2	6	13097	13102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254667461
259	NC_013010	G	6	6	13126	13131	0 %	0 %	100 %	0 %	254667461
260	NC_013010	CGT	2	6	13153	13158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254667461
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262	NC_013010	GGCC	2	8	13242	13249	0 %	0 %	50 %	50 %	254667461
263	NC_013010	TGA	2	6	13257	13262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667461
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391	NC_013010	AGG	2	6	19131	19136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254667466
392	NC_013010	ATG	2	6	19145	19150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254667466
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